دانشگاه گیلان تحقیقات تولیدات دامی 2252-0872 1 1 2012 05 21 Designing a software for prediction of animal breeding values using quantitative and molecular information طراحی نرم‌افزار پیش‌بینی ارزش ارثی حیوانات با استفاده از اطلاعات کمی و مولکولی 29 36 268 FA ثریا رفیعی دانش‌آموخته کارشناسی ارشد دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان مرادپاشا اسکندری نسب دانشیار دانشکده کشاورزی دانشگاه زنجان داریوش سلیمی پژوهشکدة فیزیولوژی و بیوتکنولوژی دانشگاه زنجان طاهر هرکی نژاد پژوهشکدة فیزیولوژی و بیوتکنولوژی دانشگاه زنجان روناک خرمتایی پژوهشکدة فیزیولوژی و بیوتکنولوژی دانشگاه زنجان Journal Article 2015 06 21 The present study was attempted to produce MAS software. This software uses a combination of quantitative and molecular information for the prediction of breeding values. Some genes that control a trait have major effects comparing with others. These genes are called major genes which are located on QTLs (quantitative trait loci). Our understanding on inheritance pattern of QTL can be helpful in selection programs via marker assisted selection (MAS). This provides an opportunity to increase the genetic progress of domestic animals by MAS. The marker assisted selection performance are based on an index, consists of phenotypic and molecular markers data. The MAS software based on mixed model methods (MMM) was established with the C# programming language. This software designed based on animal models with matrix form for predicting breeding values. To identify polymorphism in promoter region of DGAT1 gene, DNA was extracted from blood samples, the PCR process performed on DNA samples. Allelic and genotypic frequencies of animals were characterized. MASS software was used for the prediction of breeding values for 80 male lambs of Afshari sheep in research-education farm of Zanjan University. To compare the results, analyses were also performed using SAS software. Comparing the predicted breeding values obtained from MAS software and SAS indicated the effect of molecular marker in selection based on the combination of molecular and phenotypic information. در تحقیق حاضر اقدام به تولید نرم­افزار MAS شد. این نرم­افزار برای پیش­بینی ارزش ارثی از تلفیق اطلاعات کمی و مولکولی استفاده می­نماید. بعضی از ژن­هایی که یک صفت را کنترل می­کنند، می­توانند نسبت به بقیه دارای اثرات بزرگی باشند. این قبیل ژن­ها، ژن­های با اثر بزرگ نامیده می­شوند که در QTL هامکان<strong>­</strong>یابی می­شوند. دنبال کردن الگوی توارث این قبیل QTLها می­تواند برای کمک به انتخاب مورد استفاده قرار بگیرد. این موضوع مجالی برای افزایش برنامه­های پیشرفت ژنتیکی حیوانات اهلی به وسیله انتخاب به کمک نشانگرها (MAS) را فراهم می­سازد. کارایی انتخاب به کمک نشانگرها بر شاخصی متشکل از اطلاعات فنوتیپی و مولکولی پایه گذاری شده است. نرم افزار MAS براساس روش­های مدل مختلط (MMM) با زبان برنامه­نویسی C<strong>#</strong> تهیه شد. در این نرم افزار از مدل دام برای پیش­بینی ارزش ارثی به فرم ماتریسی استفاده شد. با تعیین پلی‌مورفیسم ناحیه پروموتور ژن DGAT1، پس از استخراج DNA از نمونه­های خون، مراحل PCR روی نمونه‌های DNAانجام گرفت. فراوانی­های آللی و ژنوتیپی حیوانات مشخص شد. از نرم افزار MAS برای پیش بینی ارزش ارثی تعداد 80 رأس از بره­های نر گله اصلاح نژادی طرح ملی اصلاح نژاد گوسفند افشاری مزرعه آموزشی دانشگاه زنجان استفاده شد. جهت مقایسه نتایج پیش بینی ارزش ارثی با روش مذکور، از نرم افزار SAS استفاده شد. مقایسه نتایج پیش­بینی ارزش ارثی با نرم­افزار MAS و SAS، نشان­دهنده اثر ورود نشانگرهای مولکولی در انتخاب براساس تلفیق اطلاعات کمی و مولکولی است. https://ar.guilan.ac.ir/article_268_995dcf27c1a9b5a0ed653ed8fc03e9bf.pdf