بررسی تنوع ژنتیکی ژن پروتئین پرایون در گوسفندان نژاد مهربان و رومانف

نوع مقاله : مقاله پژوهشی

نویسندگان

1 دانش‌آموخته کارشناسی ارشد ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا

2 استادیار گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه بوعلی سینا

3 دانش‌آموخته دکتری ژنتیک و اصلاح نژاد دام، گروه علوم دامی، دانشکده علوم کشاورزی، دانشگاه گیلان

چکیده

این پژوهش جهت بررسی چندشکلی در اگزون 3 ژن پروتئین پرایون (PRNp ) در گوسفندان نژاد مهربان و رومانف انجام شد. از 124 رأس گوسفند (85 رأس نژاد مهربان و 39 رأس نژاد رومانف) نمونه‌های خون جمع‌آوری شد. پس از استخراج DNA، واکنش زنجیره‌ای پلی‌مراز با استفاده از یک جفت پرایمر اختصاصی جهت تکثیر یک قطعه 173 جفت بازی از اگزون 3 ژن پروتئین پرایون بکار گرفته شد. چندشکلی‌های قطعه مورد نظر با استفاده از تکنیک SSCP و تعیین توالی DNA تعیین و مورد ارزیابی قرار گرفتند. در هر دو نژاد مهربان و رومانف، سه الگوی متفاوت باندی (ژنوتیپ‌های AA، AG و GG) همراه با یک چندشکلی تک‌نوکلئوتیدی (g.625A>G) شناسایی شد که منجر به تغییر یک اسید آمینه (p.171 R>Q) می‌شود. سه هاپلوتایپ شامل ARR/ARR، ARR/ARQ و ARQ/ARQ شناسایی شد که بیشترین فراوانی (به ترتیب 2/61 و 15/46 درصد در نژاد مهربان و رومانف) مربوط به هاپلوتایپ دارای مقاومت بالا به بیماری اسکراپی (ARR/ARR) بود. نتایج پژوهش حاضر با توجه به شباهت چندشکلی‌ها در ژن PRNP نژادهای داخلی و خارجی می‌تواند در برنامه‌های اصلاح نژادی گوسفند مورد استفاده قرار گیرند.

کلیدواژه‌ها

موضوعات


عنوان مقاله [English]

Evaluation of genetic variations of the PRNP gene in Mehraban and Romanov sheep breeds

نویسندگان [English]

  • M. Hashemi 1
  • A. Ahmadi 2
  • R. Abdoli 3
1 MSc. Graduated in Animal Breeding and Genetics, Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran
2 Assistant Professor, Department of Animal Science, Faculty of Agriculture, Bu-Ali Sina University, Hamedan, Iran
3 Ph.D Graduated in Animal Breeding and Genetics, Department of Animal Science, Faculty of Agricultural Sciences, University of Guilan, Rasht, Iran
چکیده [English]

This study was conducted to investigate the polymorphisms of the Prion protein gene (PRNp < /em>) exon 3 in Mehraban and Romanov sheep. Blood samples were collected from 124 sheep (85 Mahraban and 39 Romanov). After DNA extraction, polymerase chain reactions (PCR) were performed to amplify a 173 bp fragment of the PRNp < /em> gene exon 3 using a specific pair of primers. Polymorphisms of the studied fragments were explored using single strand conformational polymorphism (SSCP) and DNA sequencing analysis. In both Mehraban and Romanov breeds, three different banding patterns (AA, AG and GG genotypes) along with a single nucleotide polymorphism (g.625A>G) were identified, that deduced one amino acid substitution (p.171R>Q). Three haplotypes including ARR/ARR, ARR/ARQ and ARQ/ARQ were identified, which the most frequency (61.2 and 46.15% in Mehraban and Romanov breeds, respectively) was related to the ARR/ARR haplotype with high resistance to scrapie disease. The results of current study regarding the similarity of polymorphism in PRNp < /em> gene of domestic and foreign breeds could be used in sheep breeding programs.

کلیدواژه‌ها [English]

  • Scrapie
  • Single nucleotide polymorphism
  • Sheep
  • Genetic resistance
باتوانی ر.، ادریس م. ع.، و رحمانی ح. ر. 1391. شناسایی کدون‌های حساس به اسکراپی در سه نژاد گوسفند ایرانی. پنجمین کنگره علوم دامی ایران، دانشگاه صنعتی اصفهان. صفحه 636-634
دانش و.، حافظیان س. ح.، رحیمی میانجی ق.، و فرهادی ا. 1395. چند شکلی ژن پروتیین پرایون (prp) با استفاده از تکنیک PCR-SSCP و تعیین توالی مستقیم در گوسفندان نژاد ایرانی قزل، هرکی و ماکویی. بیوتکنولوژی کشاورزی، 8(2): 17-30.
Babar M. E., Farid A., Benkel B. F., Ahmad J., Nadeem A. and Imran M. 2009. Frequencies of PrP genotypes and their implication for breeding against scrapie susceptibility in nine Pakistani sheep breeds. Molecular Biology Reports, 36: 561-565.
Belt P. B., Muileman I. H., Schreuder B. E., Bos-de Ruijter J., Gielkens A. L. and Smits M. A. 1995. Identification of five allelic variants of the sheep PrP gene and their association with natural scrapie. Journal of General Virology, 76(3): 509-517.
Bossers A., Schreuder B. E., Muileman I. H., Belt P. B. and Smits M. A. 1996. PrP genotype contributes to determining survival times of sheep with natural scrapie. Journal of General Virology, 77(10): 2669-2673.
Boukouvala E., Gelasakis A. I., Kanata E., Frangkiadaki E., Giadinisi N., Paklaska V., Christoforiodou S., Sklaviadis T. and Ekateriniadou L. V. 2018. The association between 171 k polymorphism and resistance against scrapie affection Greek dairy sheep. Small Ruminant Research, 161: 51-56.
Dawson M., Hoinville L., Hosie B. D. and Hunter N. 1998. Guidance on the use of PrP genotyping as an aid to the control of clinical scrapie. Veterinary Record, 142: 623-625.
Goldmann W. 2008. PrP genetics in ruminant transmissible encephalopathies. Veterinary Research, 39: 30.
Karami M., Amirinia C., Emam Jome Kashan N., Amirmozafari N., Chamani M. and Banabazi M. H. 2011. Polymorphisms of the prion protein gene Arabi sheep breed in Iran. African Journal of Biotechnology, 10: 15819-15822.
Frootan F., Nikbakht G., Özgentürk N. Ö. and Ün C. 2012. Prion protein coding gene (PRNP) variability in sheep from Turkey and Iran. Biochemical Genetics, 50: 277-284.
Laurén J., Gimbel D. A., Nygaard H. B., Gilbert J. W. and Strittmatter S. M. 2009. Cellular prion protein mediates impairment of synaptic plasticity by amyloid-&bgr; oligomers. Nature, 457(7233): 1128-1132.
Luhken G., Lipsky S. H., Peter C. H. and Erhardt G. 2008. Prion protein polymorphisms in autochthonous European sheep breeds in respect to scrapie eradication in affected flocks. Small Ruminant Research, 75: 43-47.
Meydan H., Özkan M. and Yıldız M. 2013. Genetic risk assessment for atypical scrapie in Turkish native sheep breeds. Small Ruminant Research, 111: 16-22.
Oesch B., Westaway D., Wälchli M., McKinley M. P., Kent S. B. H., Aebersold R., Barry R. A., Tempst P., Teplow D. B., Hood L. E., Prusiner S. B.  and Weissmann C. 1985. A cellular gene encodes scrapie PrP 27-30 protein. Cell, 40(4): 735-746.
Sanguinetti C. J., Dias Neto E. and Simpson A. J. 1994. Rapid silver staining and recovery of PCR products separated on polyacrylamide gels. BioTechniques, 17: 914-921.
Tsunoda K., Namikawa T., Sato K., Hasnath M. A., Nyunt M. M., Rajbandary B. H., Loc C. B., Zanchiv T., Chang H., Sun W. and Dorji T. 2010 Prion protein polymorphisms and estimation of risk of scrapie in East Asian sheep. Biochemical Genetics, 48: 13-25.
Xu L., Zhang Z., Zhou X., Yin X., Yang L. and Zhao D. 2011. Molcular cloning and polymorphism analysis of the prion protein gene in tan sheep of Ningxia, China. Gene, 485(2): 102-105.
Zheng L., Li N., Fan B., Fang M. and Xu W. 2004 PRNP polymorphisms in Chinese ovine, caprine and bovine breeds. Animal Genetics, 35: 457-461.
Zhou H., Hickford J. G. H. and Fang Q. 2005. Technical Note: Determination of alleles of the ovine PRNP gene using PCR–single-strand conformational polymorphism analysis. Journal of Animal Science, 83: 745-749.